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SNP

  • 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms)

  • 是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括转换、颠换、缺失和插入,形成的遗传标记

  • 从理论上来看每一个SNP位点都可以有4种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换

    • 转换(transitions) 是指嘌呤之间,或者嘧啶之间的替换
    • 颠换(transversions) 是指嘌呤和嘧啶之间的替换
  • SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。

CNV

  • 拷贝数变异(Copy number variation)

  • 基因组发生重排而导致的,一般指长度1KB以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少